يعد الشيخ علي القاري، من المكثرين في التصنيف، وقد نسب له ما يزيد على مائة وأربعين مؤلفا، ما بين كتاب، ورسالة، وشرح، معظمها لا يزال مخطوطا، وإليك عناوين بعض مؤلفاته، مع بيان المخطوط، منها والمطبوع:
١- الأحاديث القدسية مطبوع بتحقيق أبو إسحاق الأثرى.
٢- أربعون حديثا في فضائل القرآن.
٣- الاستئناس بفضائل ابن عباس رضي الله عنهما.
٤- الأسرار المرفوعة في الأخبار الموضوعة مطبوع بتحقيق محمد لطفي الصباغ.
٥- الاصطناع في الاضطباع، رأيت نسختين منه في مكتبة عارف حكمت.
٦- الأصول المهمة في حصول المتمة، طبع مرتان آخرهما بتحقيق مشهور سلمان.
٧- الأعلام لفضائل بيت الله الحرام.
٨- الإنباء بأن العصا من سنن الأنبياء، في مكتبتي مصورة منه.
٩- أنوار الحجج في أسرار الحجج طبع بتحقيق أحمد الكردي.
١٠- بداية السالك في نهاية المسالك في شرح المناسك.
١١- بيان فعل الخير إذا دخل مكة من حج عن الغير مطبوع سنة ١٢٨٧ هـ.
١٢- تحسين الطوية في تحسين النية في مكتبة عارف حكمت نسختان منه.