٢٩ - حاشية على شرح مختصر المنتهى - في الأصول
آستان قدس رضوي رقم ٢٨٨٥؛
٣٠ - حاشية على شرح الشمسية - في المنطق
Izmir Milli رقم ١٢٧١/ ١ ورقة ١٧؛ جعفر ولي ٤٣٠ ورقة ٢١ آية اللَّه نجفي ٨٨٩/ ٢ ورقة ٥٠ - ٧٣، ٩٦٣ هـ؛ آستان قدس رضوي ١٠٣٣، ١٠١٣ هـ؛ رقم ١٢١٤٥؛ رقم ١٠٦٥١؛ طبعت في Istanbul ١٢٩٠، ١٢٩٢، ١٣٠٧، ١٣٠٩ وفي القاهرة ١٣٢٣؛ ١٣٢٨؛
٣٢ - حاشية على رسالة في لام الجنس
Emanet Hazinesi رقم ١٧٥٩/ ٢٤ ورقة ١٤١ فقط نحو سنة ١٠٧٦ هـ؛
٣٣ - حاشية على تهذيب المنطق والكلام
قيصري راشد أفندي رقم ٩٢٣٣/ ٣ ورقة ١٧٨ - ٢٣٥؛ ١٠١٥ هـ؛ رقم ١١٢٣٩/ ٢ ورقة ٧ - ١١؛ ١١٩٤ هـ؛ مكتبة الأوقاف العامّة ٥٣١٧/ ٢ ورقة ١٢٥؛ ١٢٣٩ هـ؛ آية اللَّه نجفي ٣٤٦٥ ورقة ٤٩ قيد التملك ١١٠٤ هـ؛ رقم ٧١٥/ ٤ ورقة ٩٠ - ١٤٣, ١٠٦٩ هـ؛ رقم ٨٨٩/ ١ ورقة ٤٧، ٩٦٣ هـ؛ مسجد أعظم ٢٤٤٩؛ ١٢٢٢ هـ؛ آستان قدس رضوي رقم ١٣٦٨٨، ٩٧١ هـ؛ رقم ١٠١٩، ١٠٠٠ هـ؛ رقم ١١٤٣, ١٠٣٣ هـ؛ رقم ١١٠٥٦, ١٠٣٨ هـ؛ رقم ١٠١٧؛ ١٠٧٧ هـ؛ رقم ١٠١٨؛ ١٠٧٨ هـ؛ رقم ١١٠٩٦, ١٣١٤ هـ؛ رقم ٥٩٨١؛ ١٠٦٦٤؛
٣٤ - حاشية على المحاكمات - في المنطق والفلسفة
آستان قدس رضوي رقم ٤٩٥ ينسب إليه؛
٣٥ - حاشية على المحرر - في الفقه
آستان قدس رضوي رقم ٥٨٩٦؛
٣٦ - حاشية على الزوراء - في علم الكلام
الظاهريّة عام ٢٤٥ ورقة ٨٥ - ٩٦؛ ١٣٠٢ هـ؛ آية اللَّه نجفي ٥٠٩٤/ ٤ ورقة ٦٠ - ٨٣؛ ١٠٤٢ هـ؛ رقم ٤٦٨٨/ ٢ ورقة ١٥٤ - ١٦٥؛ رقم ٩٣٥/ ٥ ورقة ١٠٤ - ١١٣؛ ١٢١٦ هـ؛ مدرسة غرب همدان ١٠١٨٧/ ٤ صفحة ٢٤٥ - ٢٧٢، ٨٧٢ هـ بخط المؤلّف؛ القاهرة ملحق ٢٠٥٥٢/ ب مجموعة ورقة ٦٨ - ٧٨؛ آستان قدس رضوي ٥٩٦٠, ١٠٩٦ هـ؛ رقم ٥٨٩٥؛ رقم ١١٣٩١؛ ملّى كتبخانه A/ ٣٢٢٧/ ٨ ورقة ١١٧ - ١٢٥؛ المكتبة القادريّة ١٤٢٣/ ٦ ورقة ٢٤ - ٣١؛ مسجد أعظم ٢٥٩٢/ ٢؛ ٩٥٧ هـ؛ القاهرة ملحق ٣٣٢٦/ ج مجموعة ورقة ١٠ بخط المؤلف؛ رقم ٢٣٤٤٧/ ب مجموعة ورقة ٣٧ - ٤٣؛ آستان قدس رضوي ٧١٥، ٩٩٤ هـ؛ رقم ٥٩٦١؛ ١٠٩٦ هـ؛ رقم ١١٠٨٨، ١٢٨٥ هـ؛ رقم ٤١٠، ٥٨٦٩، ٥٨٩٤؛
٣٧ - الحاشية الجديدة على شرح القوشجي لتجريد الكلام
بانكبور خدابخش رقم ١١٨٦ ; رقم ٣٣٣٢ ورقة ٣٩ كتب في القرن ١١ هـ؛ رقم ٣٥٤٠، ٣٥٥٢؛ كوبريلي رقم ٨٠٢ ورقة ٣٠٧؛ ٩٩٦ هـ؛ المكتبة السليمانيّة خرائن متفرّقة عقائد ١٠/ ٤ ت/ مجامع ٢٨٣٩ - ٢٨٤٢ ورقة ١٠؛ مكتبة الأوقاف العامّة ٤٣٦٧ ورقة ٤٢٠؛ ٩٧١ هـ؛ رقم ١٣٥٦٠؛ ٥٣٥٠؛ Chester Beatty رقم ٤٣٧٧ ورقة ١٦٨؛ ١٠٢٢ هـ؛ رقم ٤٣٧٨ ورقة ١٦١؛ طبعت في الآستانه ١٣٠٧؛
٣٨ - الحجج الباهرة في أفخام الطائفة الكافرة الفاجرة
أسعد أفندي رقم ١١٨٥؛
٣٩ - حقوق بدران ومادران - في الأخلاق (ف)
آية اللَّه نجفي ٨٨٠/ ٥ ورقة ١٢٩ - ١٣٠؛ ١٢٩٢ هـ
٤٠ - حلّ شبهة الجذر الأصم - في الكلام
بانكبور خدابخش ٣٦٨٢ ورقة ١، ١٢٢٣ هـ؛ كوبريلي ١٦٠٢/ ١٢ ورقة ٢٧ - ٣٣؛ Emanet Hazinesi رقم ١٧٥٩/ ٣٢ ورقة ١٧٣ - ١٨٧ نحو ١٠٧٦ هـ؛ كتابخانه حقوق ١١٢/ ب ورقة ٨٨ - ١٠٥؛ آستان قدس رضوي رقم ٦٤٠٥؛ ١١٠٦ هـ؛ رقم ٦٤١٠؛