جزء منه؛ شهيد علي رقم ٢٠٨١ ورقة ١٦٤؛ ٩٠١ هـ جزء منه؛ سليمانيه رقم ٨٥٠ ورقة ٢٠٢ جزء منه؛ نور عثمانيه ٣٥٠١ جزء ١ ورقة ٣١٨؛ ٧٢١ هـ؛ رقم ٣٥٠٢ جزء ٢ ورقة ١٥٦؛ أحمد ثالث رقم ٢١٢٥/ ٢ جزء ٢ ورقة ١٩٩؛ رقم ٢١٢٥/ ٣ جزء ٣ ورقة ٢٢٦؛ رقم B/ ٣/ ٢١٢٥ جزء ٣ ورقة ٢٦٢؛ ٦١٤ هـ؛ رقم ٢١٢٥/ ٤ جزء ٤ ورقة ٢٣٦؛ ٧١٣ هـ؛ رقم ٢١٢٥/ ٥ جزء ٥ ورقة ٢٣٤؛ رقم ٢١٢٥/ ٦ جزء ٦ ورقة ٦٩٥؛ رقم ٢١٢٥/ ٧ جزء ٧ ورقة ٢٦٢؛ ٦٢٤ هـ؛ رقم ٢١٢٥/ ١٠ جزء ١٠ ورقة ٢٥١؛ رقم ٢١٢٥/ ١٠ جزء ١٠ ورقة ١٨٢؛ رقم ٢١٢٥/ ١١ جزء ١١ ورقة ١٧٨؛ رقم ٢١٢٥/ ١٢ جزء ١٢ ورقة ١٧٩؛ ٦١٠ هـ؛ رقم ١٩٤٩ جزء ٢٠ ورقة ١١١؛ Chester Beatty رقم ٣٩٨٧ ورقة ٢٣٨؛ آية اللَّه نجفي رقم ٤٢٨٢، جزء ٣ ورقة ٩٠ نسخة قديمة؛ المدرسة الأحمديّة بالموصل مجامع ٢٤/ ٤/ ١، ١٠٣٦ هـ؛ نشر في حيدرآباد ١٩٥٥ - ١٩٧٢ على ثلاثة وعشرين جزءًا وفي أوروبا ١٥٠٩ - ١٥٤٢؛
٢٠ - الخواصّ الطبيعية - في الطبّ والكيمياء
مراد ملّا رقم ١٨٢٦ ورقة ٧٧ - ٩٠؛
٢١ - رسائل فلسفية
نشرت في القاهرة ١٩٣٩؛
٢٢ - رسالة في أن الحمية المفرطة والتقليل من الأغذية والإستكثار من الأدوية والمبادرة إلى العلاج ضارة للأصحاء
آياصوفيا رقم ٣٧٢٥/ ٣ ورقة ٥١ - ٦٧؛ رقم ٣٧٢٤، ورقة ١٧١ - ١٨٤؛ ٧٢١ هـ؛
٢٣ - رسالة في أوجاع النقريس ومداواته
أحمد باشا ٢١٣٤٠ ورقة ١١ - ٢٠؛ ١١٥٧ هـ؛ بلدية الإسكندريّة ٦٤١٨/ د ورقة ٢٠، ٥٩٥ هـ؛
٢٤ - رسالة في القول في الإستدلال على ماهية البول
أحمد باشا رقم ٣٤٠/ ٣ ورقة ٢١ - ٢٤؛
٢٥ - رسالة في الشراب - في الطبّ
المكتبة الوطنيّة بمدريد رقم ٥٢٤٠ مجموعة ورقة ١٥، ٨٢٨ هـ؛
٢٦ - رسالة في تقديم الفواكه على الطعام وعكسه
وهبي أفندي رقم ١٤٨٨/ ١٩ ورقة ١٩٧ - ١٩٨؛ ١٠٥٨ هـ؛ شهيد علي؛ رقم ٢٠٩٢/ ٤ ورقة ٦٣ - ٦٥؛ ٧٥٠ هـ؛ رقم ٢٠٩٥ ورقة ٩٧ - ١٠٠؛ ٩١٥ هـ، آياصوفيا رقم ٣٧٢٤/ ١٤ ورقة ١٥٥ - ١٥٩؛ ٧٢١ هـ؛
٢٧ - رسالة في صفة الموميا ومنافعه - في الطبّ
شهيد علي رقم ٢٠٢٦/ ٢ ورقة ٣٣٧ - ٣٣٨؛ ٩٦٩ هـ؛
٢٨ - الرسالة الوبائية - في الطبّ
متحف الآثار رقم ٧٣٨ ورقة ٤٩٣ - ٥٠٢؛ ١٠٩٥ هـ؛
٢٩ - رسالة في حصاة الكلى والمثانة - في الطبّ
خزانة الدكتور داود جلبي مجامع رقم ٩/ ٣١ / ٢؛ نشرت في Paris ١٨٩٠ وفي Leiden ١٨٩٦ وفي ألمانيا ١٤٠٦ مصوّرة بالأوفست؛
٣٠ - سرّ الأسرار - في الكيمياء
آستان قدس رضوي رقم ١٠٩٢٢، ١٢٣٩ هـ؛ نشر في طاشكند ١٩٥٧ نشر مصورا عن الأصل المخطوط وفي طهران ١٣٤٣/ ١٩٦٤؛
٣١ - سرّ صناعة الطبّ
الخزانة المَلِكِيَّة بالرباط طبّ مجموعة رقم ٣٤٧٧ ورقة ١٩؛ الأسكوريال ثان ٣/ ٨٣٣؛ أوبسالا أول ٣٤١؛ برنستون ١٧٠؛ ماكس مايرهوف ٩٨ ورقة ١٧؛ ١٣٤٤ هـ؛ المكتبة الوطنيّة بمدريد ٥٢٤٠ مجموعة ورقة ١٩، ٨٢٨ هـ؛
٣٢ - شرح الأسماء من الأدوية المفردة الّتي يمكن أن يحتاج إليها في تركيب الأدوية
الظاهريّة عام طبّ ٤٧٣١ ورقة ٨؛ ١١٨٢ هـ؛
٣٣ - الشكوك على كلام فاضل الأطباء