٤ - أسرار الكيمياء
نشرت في Paris ١٨٩٢؛
٥ - الإيضاح - في الكيمياء
آستان قدس رضوي ١٠٧٣٩، ١٢٢٦ هـ؛ رقم ١٠٧٤٨ , ١٢٩٦ هـ؛ المكتبة الخديوية ٦٢٣٤/ ٢؛ نشر في ١٩٢٨ Paris؛
٧ - تدبير الإكسير الأعظم
نشر في دمشق ١٩٨٨ فيه أربع عشرة رسالة في صنعة الكيمياء؛
٨ - تفسير كتاب الإسطقصاآت
نشر في Paris ١٩٢٨ وفي Bombay طبعة حجر بدون تاريخ؛
٩ - جنات الخلد - في الكيمياء
آستان قدس رضوي ١٠٧٩٥؛ ١٢٦٦ هـ؛
١٠ - الحاصل في الكيمياء
جامعة الرياض ٧٥٧٠ ورقة ٣؛
١١ - الخواصّ الصغيرة - في الكيمياء
آية الله نجفي ٣٦٣٤ , ورقة ٨٢؛ ١١٠٧ هـ؛
١٢ - الخواصّ الكبيرة= المقالات الكبرى= الرسائل السبعية= الجامع - في الكيمياء
وهبي أفندي ٢٢٨٠؛ ولي الدين أفندي ٢٥٦٤؛ بلدية الإسكندرية ٤٥٢٠٤/ج ورقة ١٦١ كتبت في القرن ١٣ هـ؛ آستان قدس رضوي رقم ١٠٧٩٨، ١٢٧٨ هـ؛ رقم ١٠٦٨٠؛
١٣ - خواص سور القرآنية
أحمد ثالث ١٣٢ ورقة ١٣ - ٢٧؛
١٤ - الرحمة الصغير لجابر؛
الظاهريّة عام ٩٦٤٩ ورقة ٦٧ - ٧٠؛ ١٠٤٨ هـ؛
١٥ - رسائل في العلوم الكيماوية والصنعية
نشرت في Paris ١٨٩٣؛
١٦ - رسائل جابر بن حيان - في الكيمياء
آستان قدس رضوي ١١٠٤٨ , ١٢٦٧ هـ؛
١٧ - رسالة في الجفر - في الخواص
جار الله أفندي ٨٩٥؛ مشهد ٥٢٦٩؛
١٨ - رسالة في موازين علم الكاف
الظاهريّة عام ١٠١٠٢ ورقة ٣٤؛
١٩ - رسالة في تدبير الحجر الكريم - في الكيمياء
القاهرة ملحق مجموعة ٣٧٣٥/ ك ورقة ٥٧ - ٥٨؛ رقم ١٤/ ش لوحة ١١٣ - ١١٥ نسخة مصوّرة، رقم ١٥/ ش نسخة مصورة؛ دار الكتب المصريّة ٣٧٣٥/ك؛ آستان قدس رضوي رقم ١١٠٠٣؛ حسن حسني عبد الوهّاب بتونس ١٨٠٣٢/ ٤ ورقة ٤٨ - ٥٠؛ آية الله نجفي ١٤١٤/ ١ ورقة ٧، ١٢٦٥ هـ؛ نشرت في Paris ١٩٢٨ وفي Bombay طبعة حجر بدون تاريخ؛
٢٠ - رياض الأكبر - في الكيمياء
آستان قدس رضوي رقم ٥٧٦٨؛
٢١ - سر السار وسرّ الأسرار - في الكيمياء
شهيد علي رقم ١٧٤٩/ ٥؛ آستان قدس رضوي ١٢٢٠٤ ,١٢٠٧ هـ؛ رقم ١٠٧٩٩؛
٢٣ - شرح كتاب الرحمة - في الكيمياء
جار الله أفندي رقم ١٦٤١؛
٢٤ - شرح مصححات أفلاطون
القاهرة ملحق ٩٦/ ش ورقة ٨٠ - ١٣٠٦ هـ؛ رقم ١٠٦/ ش ورقة ١٨٠ , ١٣٦٤ هـ؛ دار الكتب المصريّة رقم ٩٦/ ش؛
٢٥ - الصافي - في الكيمياء
آية الله نجفي ٣٣٨٦/ ٦ ورقة ٩٩ - ١٢٧، ١٢٦٨ هـ؛ آستان قدس رضوي ١٠٧٩٥ ,١٢٧٦ هـ؛
٢٦ - صنعة الماء المرّ من الماه المعروف بـ (المرّ) = صنعة ماء الكبريت وصنعة الماء السريع
نشرت في أوربا ١٩٣٩؛
٢٧ - الطبيعة الخامسة - في الفلسفة
آية الله نجفي ٣٣٨٦/ ١٢ ورقة ٢٢٧ - ٢٣٥، ١٢٦٨ هـ؛
٢٨ - علم الكتف (الكاف) والخواصّ في الطب
ملّي كتبخانه ٤٤٤١ A ورقة ٥٦؛ ١١٩٨ هـ؛
