وعقب انهيار الشيوعية سنة ١٤١١ هـ/١٩٩٠ م تأسس في البوسنة حزب إسلامي بزعامة المحامي/علي عزت بيغوفيتش، وفي سنة ١٤١٢ هـ/١٩٩١ م طالب السكان بالاستقلال بعد استفتاء عام، فأعلنت الدولة استقلالها بزعامة علي عزت بيجوفيتش الذي فاز في الانتخابات الرئاسية.
ومنذ استقلالها عاشت البوسنة والهرسك مأساة حقيقية وصراع دامي من جراء العدوان الصربي الوحشي. وأسأليب التطهير الديني العرقي ضد المسلمين، ومحاولة إنهاء الوجود الإسلامي، وبدعم مستتر من الدول الغربية وروسيا والعالم الصليبي أجمع. لمنع وجود دولة مسلمة في أوروبا.
* * *
انتهاء المأساة:-
في سنة ١٤١٦ هـ/١٩٩٦ م وقع زعماء البوسنة وكرواتيا والصرب على معاهدة في باريس لإنهاء الحرب، وقسمت البلاد بين الصرب وبين اتحاد المسلمين/الكروات، وتخوض البوسنة الآن معركة البناء والتعمير لإصلاح ما خربته الحرب. تؤكد الإحصائيات أن ضحايا المسلمين خلال هذه الحرب (٩١ - ٩٦ م) تجاوزوا ٢٠٠ ألف قتيل، وتم اغتصاب أكثر من ٥٠ ألف مسلمة، وفوجئ العالم بالمذابح والمقابر الجماعية التي ارتكبها الصرب ضد المسلمين.