- ضبط النص وتقسيمه إلى فقرات وترقيمه بعلامات الترقيم المناسبة ومنها:
() القوسان الهلاليان للآيات المفسرة ولأرقام الحواشي، ولأسماء الكتب والبلدان.
[] المعقوفان لما زاد على النص من كتب التفسير في المواضع غير الواضحة أو ليست في النسخة المخطوطة. ولبحور الشعر للأبيات الشعرية الشواهد في التفسير أو في الحواشي.
/ () الخط المائل والقوسان الهلاليان علامة انتهاء الصفحة المخطوطة ورقمها.
"" علامتا التنصيص للنقولات.
-- الشرطتان الأفقيتان للجمل الاعتراضية.
- بالإضافة إلى العلامات الأخرى المعروفة كالنقطة، والفاصلة، والفاصلة المنقوطة، وعلامتي التعجب والاستفهام، وغيرها.
- عمل فهارس عامة، وشملت:
- فهرس القراءات القرآنية.
- فهرس الأحاديث والآثار.
- فهرس الأشعار والأمثال.
- فهرس الأعلام المعرّفة.
- فهرس الأماكن والبلدان.
- فهرس المحتويات.
[وصف النسخة المخطوطة وعرض نماذج لبعض صورها]
تقع نسخة دار الكتب المصرية - التي اعتمدناها في التحقيق - في ثلاثمائة واثنتين وخمسين ورقة (٣٥٢)، في كل ورقة صفحتان، وأسطر الصفحة الواحدة واحد وعشرون سطرا (٢١)، في مجلدين:
بدأ المجلد الأول بصفحة العنوان كتب عليه:(تفسير القرآن العظيم للشيخ الإمام العالم العامل العلامة فريد دهره ووحيد عصره علم الدين أبي الحسن علي بن محمد بن عبد الصمد السخاوي تغمده الله برحمته آمين).
ثم بدأ بمقدمة للمصنف - رحمه الله تعالى - ثم شرع في التفسير من أول سورة الفاتحة إلى سورة الشعراء في مائة وستين ورقة (١٦٠) في كل ورقة صفحتان كتب بخط واضح، وبه