الشامي بعقب البطيخ، كتاب في نقض كتاب أنابوا إلى فرفوريوس في شرح مذاهب أرسطاليس في العلم الإلهي، كتاب في الخلاء والملاء وهما الزمان والمكان، كتاب الصغير في العلم الإلهي، كتاب الهيولي المطلقة والجزئية، كتاب إلى أبي القاسم البلخي في الزيادة على جوابه وعلى جواب هذا الجواب، كتاب الرد على أبي القاسم البلخي في نقضه المقالة الثانية في العلم الإلهي، كتاب الجدري والحصبة، كتاب الحصى في الكلى والمثانة، كتاب إلى من لا يحضره طبيب، كتاب الأدوية الموجودة بكل مكان، كتاب الطب الملوكي، كتاب التقسيم والتشجير، كتاب اختصار كتاب النبض الكبير لجالينوس، كتاب الرد على الجاحظ في نقص الطب، كتاب مناقضة الجاحظ في كتابه في فضيلة الكلام، كتاب الفالج، كتاب اللقوة، كتاب هيئة الكبد، كتاب النقرس وعرق المديني، كتاب هيئة العين، كتاب الأنثيين، كتاب هيئة القلب، كتاب هيئة السماخ، كتاب أوجاع المفاصل اثنان وعشرون فصلاً، كتاب أقراباذين، كتاب الانتقاد والتحرير على المعتزلة، كتاب الخيار المر، كتاب كيفية الاغتذاء، كتاب إبدال الأدوية، كتاب خواص الأشياء، كتاب الهيولي الكبير، كتاب سبب وقوف الأرض وسط الفلك، كتاب سبب تحرك الفلك على استدارة، كتاب في نقض الطب الروحاني على ابن اليمان، كتاب في إنه لا يمكن أن يكون العالم لم يزل على مثال ما نشاهده، كتاب في أن الحركة ليست مرئية بل معلومة، كتاب في أن الجسم يتحرك من ذاته، وأن الحركة مبدأ طبيعته، كتاب في الشكوك التي على برقلس، كتاب تقسيم الأمراض وأسبابها وعلاجاتها على الشرح، كتاب تفسير كتاب فلوطرخس في تفسير كتاب طيماوس، كتاب نقضه على سهيل البلخي فيما ناقضه به من اللذة، كتاب في العلة التي لها يحدث الورم من الزكام في رءوس بعض الناس، كتاب في التلطف في إيصال العليل إلى بعض شهواته، كتاب العلة في خلق السباع والهوام، كتاب على ابن اليمان في نقضه على المسمعي