وقعت الحكومتان المصرية والبريطانية اتفاقية يتم بمقتضاها منح السودان حق تقرير المصير في خلال ثلاث سنوات كفترة انتقالية تطبيقا لبنود الاتفاق. وقد تمت أول انتخابات نيابية في السودان في أواخر عام ١٩٥٣ وتم تعيين أول حكومة سودانية وذلك في ٩ يناير ١٩٥٤. بالإضافة إلى ترك المناطق التي استحوذ عليها البارونات في أيديهم فإن الإنجليز لم يفعلوا شيئا في سبيل تنمية السودان أو إقامة البنية الأساسية في الشمال أو الجنوب. وفي ١٩ أغسطس قامت وحدات من الجيش السوداني الجنوبي بالتمرد وتم القضاء على حركة التمرد عن طريق الجيش. وفي ٣٠ أغسطس وافق البرلمان على إجراء استفتاء عام لتحديد مستقبل البلاد السياسي وفي نفس الوقت وافقت مصر وبريطانيا على الانسحاب من السودان في ١٢ نوفمبر ١٩٥٥ وفي ١٩ ديسمبر أعلن البرلمان السودان كدولة مستقلة بعد إجراء الاستفتاء العام. ورغم كثرة الرجوع لهذه الفترة من تاريخ السودان باسم (الحكم الإنجليزي المصري أو الحكم المشترك) وما قبلها باسم (الحكم التركي المصري) فإن مصر نفسها كانت مستعمرة من قبل الدولتين في ذلك الزمن، وإنما كانت هذه التسمية مناورة من البريطانيين في محاولة لمنع فرنسا من التدخل في السودان، وفي الواقع كانت الفترة الأولى هي فترة الحكم التركي مع تدخل بريطاني، والثانية هي فترة الحكم البريطاني والتي انتهت بالاستقلال التام. وقد أعلنت جمهورية السودان رسميا في ١ يناير ١٩٥٦ وقد أصبح السودان عضوا في جامعة الدول العربية في ١٩ يناير وفي الأمم المتحدة في ١٢ نوفمبر من نفس العام.
(تنبيه): التاريخ الميلادي تقريبي نظراً لاشتماله على أكثر من عام هجري أحياناً