أنشئت الجامعة الإسلامية بالمدينة المنورة في عام ١٣٨١ هـ الموافق ١٩٦١م لأبناء العالم الإسلامي كله ليتفقهوا في دين الله ويتضلعوا في علوم الشريعة واللغة العربية ثم يعودوا إلى بلادهم حاملين مشاعل الهدى يدعون الناس إلى كتاب الله وسنة رسوله، وينقلون إليهم نور العلم والعرفان، ومنذ إنشائها تلقى عناية خاصة من حكومة المملكة العربية السعودية نظراً لعالميتها وشمول نفعها وشرف مكانها. وتتدرج الجامعة منذ إنشائها في مجال التقدم والازدهار كأكبر مصدر للإشعاع الروحي وأزهى مشعل للهداية.
ويمكن تلخيص الأهداف التي حددها نظام الجامعة فيما يلي:
أولا- تعليم الطلاب الذين يوفدون إليها من شتى أنحاء العالم اللغة العربية والعلوم الإسلامية متزودين من سائر العلوم والمعارف التي تؤهلهم للقيام بمهمة الدعوة إلى الإسلام وتنوير المسلمين في شؤون دينهم ودنياهم على هدى الكتاب والسنة ونهج السلف الصالح.
وثانيا- نشر رسالة الإسلام بين الشعوب المختلفة وغرس روح الدين بين الأفراد والجماعات وتطبيق الشريعة الإسلامية الغراء في حياة الفرد والجماعة وتعميق هذه الروح بكل الوسائل الممكنة.
وثالثا- إعداد الدعاة المخلصين في مجال تبليغ رسالة الإسلام إلى العالم عن طريق الدعوة والتعليم والإرشاد والقدوة الحسنة.
وأنشئت في الجامعة كلية خاصة باسم كلية الدعوة وأصول الدين لتحقيق هذا الهدف المنشود على وجه أتم وصورة أشمل.
ورابعا- تجميع التراث الإسلامي والعناية بتحقيقه ونشره. ولهذا الغرض تهتم الجامعة بإقامة الروابط العلمية والثقافية بالجامعات والهيئات العلمية في مختلف بلدان العالم.