أنشئت الجامعة الإسلامية بالأمر الملكي رقم ١١وتاريخ ٢٥/٣/١٣٨١هـ وتلاه الأمر الملكي رقم ٢١ وتاريخ ١٦/٤/١٤٨١هـ بالمصادقة على نظام المجلس الاستشاري الأعلى للجامعة وبدأت الدراسة فيها يوم الأحد ٢ من جمادى الآخرة في العام نفسه. وفي ١٨/٥/١٣٨٦هـ صدر المرسوم الملكي رقم م/١٨بالموافقة على نظام الجامعة. وبعد ذلك صدر نظام آخر للجامعة وفقاً للمرسوم الملكي رقم م/٧٠ وتاريخ ٧/٨/١٣٩٥هـ. ثم صدور نظام مجلس التعليم العالي والجامعات بالمرسوم الملكي رقم م/٨ وتاريخ ٤/٦/١٤١٤هـ.
وقد حدد نظام الجامعة أهدافها فيما يلي:
أ- تبليغ رسالة الإسلام الخالدة إلى العالم عن طريق الدعوة والتعليم الجامعي والدراسات العليا.
ب- غرس الروح الإسلامية وتنميتها وتعميق التدين العملي في حياة الفرد والمجتمع المبني على إخلاص العبادة لله وتجريد المتابعة لرسول الله صلى الله عليه وسلم.
جـ- إعداد البحوث العلمية وترجمتها ونشرها وتشجيعها في مجالات العلوم الإسلامية والعربية خاصة وسائر العلوم وفروع المعرفة الإنسانية التي يحتاج إليها المجتمع الإسلامي عامة.
د - تثقيف من يلتحق بها من طلاب العلم من المسلمين من شتى الأنحاء وتكوين علماء متخصصين في العلوم الإسلامية والعربية، وفقهاء في الدين متزودين من العلوم والمعارف بما يؤهلهم للدعوة إلى الإسلام، وحل ما يعرض للمسلمين من مشكلات في شؤون دينهم ودنياهم على هدى الكتاب والسنة وعمل السلف الصالح.
هـ- تجميع التراث الإسلامي والعناية بحفظه وتحقيقه ونشره.
و إقامة الروابط العلمية والثقافية بالجامعات والهيئات والمؤسسات العلمية في العالم وتوثيقها لخدمة الإسلام وتحقيق أهدافه.