١- قسم الفقه ويدخل في اختصاصه المواد التالية: الفقه المقارن، تاريخ التشريع، والفرائض.
٢ - قسم أصول الفقه، ويدخل في اختصاصه المادتان التاليتان: أصول الفقه، والقواعد الفقهية.
٣ - قسم القضاء والسياسة الشرعية، ويدخل في اختصاصه المواد التالية: السياسة الشرعية، وتاريخ القضاء، والقضاء في الإسلام.
٢ - كلية الدعوة وأصول الدين (١)
أولاً - النشأة والأهداف والتطور:
للعناية بأمر الدعوة الإسلامية، وتنقية العقيدة، وترسيخها في النفوس صحيحة صافية، خالية من البدع والخرافات والفلسفات الضالة، وغرس الروح الإسلامية، وتنميتها في حياة الأفراد والجماعات والمجتمعات - أنشئت في الجامعة الإسلامية بالمدينة المنورة عام ١٣٨٦هـ كلية الدعوة وأصول الدين وفقاً للأمر السامي الكريم ذي الرقم ٣٣٢/م المؤرخ في ٤/٥/١٣٨٦هـ، وبدأت الدراسة فيها في يوم السبت ١/٧/١٣٨٦هـ، وقد بلغ عدد طلابها عند الافتتاح (٥٧) طالباً وفي عام ١٤٢٢ - ١٤٢٣هـ بلغ (٦٨٩) طالباً.
وتهدف هذه الكلية إلى العناية بالعقيدة الإسلامية، وإعداد دعاة إلى الله، متضلعين بعلوم الشريعة، قادرين على القيام بالدعوة إلى الله على بصيرة وملمين بالوسائل اللازمة لتحقيق هذه الغاية، ينتشرون في أنحاء المعمورة، يهدون الناس إلى ما فيه صلاحهم، وعلاج مشكلاتهم، وتحقيق أمنهم وسعادتهم في دنياهم وأخراهم، استجابة لقول الله تبارك وتعالى:{فَلَوْلا نَفَرَ مِنْ كُلِّ فِرْقَةٍ مِنْهُمْ طَائِفَةٌ لِيَتَفَقَّهُوا فِي الدِّينِ وَلِيُنْذِرُوا قَوْمَهُمْ إِذَا رَجَعُوا إِلَيْهِمْ لَعَلَّهُمْ يَحْذَرُونَ} التوبة/٢٢.
ثانياً - الأقسام العلمية بالكلية:
١- قسم العقيدة، ويدخل في اختصاصه المواد التالية: التوحيد، والأديان والفرق.
٢- قسم الدعوة، ويدخل في اختصاصه المواد التالية: أصول الدعوة وطرقها، والغزو الفكري، وتاريخ الدعوة.