ويبلغ مجموع طلبة الجامعة في الوقت الحاضر حوالي ٦ آلاف (٦٠٠٠) طالب من مائة دولة من مختلف قارات العالم، (أما عدد الطلاب الهنود فيها الآن فيزيد عن مائة وخمسون طالبا) . وهم موزعون بين مختلف المعاهد والكليات وقسم الدراسات العليا. ويحصل الطالب على منحة دراسية شهرية طوال العام. وفضلا عن المكافأة الشهرية يتمتع طالب الجامعة بالامتيازات التالية:
١- استقدام الطالب من بلده جوًّا على حساب الجامعة عند قبوله بها وترحيله عند تخريجه.
٢- ترحيل الطلاب في العطلة الصيفية إلى بلادهم ذهابا وإيابا على حساب الجامعة كل عام تيسيرا لالتقاء الطالب بأهله وقومه.
٣- تأمين السكن المؤثث دون مقابل للطلاب من داخل الحرم الجامعي أو خارجه.
٤- تقديم وجبات طعام عن طريق "مطعم الجامعة"مقابل اشتراك رمزي.
٥- تأمين جميع الكتب الدراسية المقررة لكل طالب بالمجان.
٦- تأمين المواصلات بسيارات الجامعة (بين مقر الجامعة والمدينة المنورة) صباحا للحضور إلى الدراسة، وعند انتهائها وفي المساء وفي أيام العطل للصلاة بالمسجد النبوي الشريف.
٧- صرف ١٠٠٠ (ألف ريال) لكل طالب ينجح بتقدير ممتاز، من جميع سنوات الدراسة بكليات الجامعة.
٨- أنشئت في الجامعة إدارة لشؤون الإشراف والتوجيه الاجتماعي تعنى بتوفير الرعاية للطلاب في حياتهم السكنية والدراسية ومعاونتهم على حل مشكلاتهم وتنمية علاقات الأخوة والمودة والتعاون فيما بينهم. وإن الجامعة الإسلامية الآن مظهر من أهم مظاهر وحدة المسلمين فإذا زرت كليات الجامعة ومعاهدها ومهاجعها تجد ملامح هذه الوحدة كأروع ما يكون حيث ترى الطلاب من مختلف الأجناس واللغات والألوان والأوطان يعيشون تحت راية الإسلام وحظيرة العلم وشعارهم: لا إله إلا الله محمد رسول الله ورايتهم: العلم رحم بين أهله.