ومن آثار اهتمام حكومة المملكة - أدام الله توفيقها - بهذه الجامعة وعنايتها بها وحرصها على تعميم نفعها ما حصل لها من توسع في مجال الدراسات العالية وفي مجال الدراسات العليا، فحصل لها نمو أفقي يتمثل بافتتاح ثلاث كليات خلال ثلاث سنوات، فقد افتتحت كلية القرآن الكريم والدراسات الإسلامية في عام ٩٤/١٣٩٥هـ، وافتتحت كلية اللغة العربية والآداب في عام ٩٥/١٣٩٦هـ، وافتتحت كلية الحديث الشريف والدراسات الإسلامية في عام ٩٦/١٣٩٧هـ، وبحمد الله إن الجامعة الإسلامية سبقت إلى افتتاح كلية القرآن الكريم والدراسات الإسلامية وكلية الحديث الشريف والدراسات الإسلامية، في عام ٩٦/١٣٩٧هـ، وهما أول كليتين من نوعهما في العالم، وحصل للجامعة نمو رأسي بافتتاح قسم الدراسات العليا لمنح درجة الماجستير ثم الدكتوراه، وقد افتتح هذا القسم في أول العام الدراسي ٩٥/١٣٩٦هـ، وخلال أشهر قليلة بمشيئة الله يبدأ في هذه القاعة بمناقشة الرسائل المقدمة لنيل درجة الماجستير.
أيها الإخوة الخريجون، يسرني أن أهنئكم بإتمام دراستكم العالية في هذه الجامعة، وبهذا التكريم الذي ظفرتم به، وهو رعاية سمو الرئيس الأعلى للجامعة حفل تخرجكم وتفضله بتسليم شهاداتكم لكم، وأحب أن ألفت أنظاركم إلى أن نيل هذه الشهادة لا يعني انتهاءكم من الدراسة، وإنما يعني وصولكم إلى بداية طريق العلم ودخولكم ميدان العمل، ودراستكم في هذه الجامعة إنما هي وسيلة إلى غاية نبيلة هي الدعوة إلى الخير والتحذير من الشر، وأسأل الله تعالى أن يزيدكم علما وهدى وأن يوفقكم لما فيه رضاه ونفع عباده.