معطوفة على محذوف، تقديره: فهرب من قومه، فركب السفينة، فوقفت، فاقترعوا، فرموه، فالتقمه الحوت، فنادى في الظلمات، والجملة المحذوفة معطوفة على جملة فظن. {أَن}: مخففة من الثقيلة، واسمها ضمير الشأن؛ أي: أنه. {لَا}: نافية تعمل عمل ان. {إِلَهَ}: في محل النصب اسمها، وخبر لا محذوف جوازًا تقديره: موجود. {إِلَّا}: أداة استثناء مفرغ. {أَنْتَ}: ضمير رفع منفصل، في محل الرفع بدل من الضمير المستكن، في خبر {لَا}، وجملة {لَا} من اسمها وخبرها في محل الرفع، خبر {أَن} المخففة، وجملة {أَن} المخففة في محل الجر بحرف جر محذوف: تقديره: بأنه لا إله إلا أنت، ويجوز أن تكون {أَن} مفسرة؛ لأن النداء فيه، معنى القول دون حروفه، {سُبْحَانَكَ}: مفعول مطلق لفعل محذوف تقديره: أسبحك سبحاناً، والجملة المحذوفة حال من ضمير أنت؛ أي: حالة كونك منزهًا، عن كل ما لا يليق بك. {إِنِّي}: ناصب واسمه. {كُنْتُ}. فعل ناقص واسمه. {مِنَ الظَّالِمِينَ}: خبره، وجملة كان في محل الرفع خبر {أَن}، وجملة {أَن} مستأنفة مسوقة لتعليل فعل محذوف، تقديره: فارحمني؛ لأني كنت من الظالمين.
{فَاسْتَجَبْنَا}: {الفاء}: عاطفة. {استجبنا} فعل وفاعل. {لَهُ} متعلق به، والجملة معطوفة على جملة {نادى}. {وَنَجَّيْنَاهُ}: فعل وفاعل ومفعول. {مِنَ الْغَمِّ} متعلق به، والجملة معطوفة على جملة {استجبنا}. {وَكَذَلِكَ} الواو استئنافية. {كذلك} جار ومجرور صفة لمصدر محذوف. {نُنْجِي الْمُؤْمِنِينَ} فعل ومفعول، وفاعله ضمير مستتر، يعود على الله والتقدير: وننجي المؤمنين قاطبة من كربهم، إنجاء مثل إنجائنا يونس من غمه، والجملة الفعلية مستأنفة.